河长制的首要任务是——河长考核断面的水质达标。

　　从流域的尺度来说，截污管网的服务范围只占流域范围的一小部分。加上截污管网服务范围内所产生的污水也不能全部纳管，雨污合流制的污水管网系统在下雨时段有污水外溢入河也是常事。在可见的将来，截污管网的效能也不会有重大突破。那么，有污水流入河道是今后长期存在的客观事实。所以，在水质不达标的河长考核断面治理方案中，强调以新建截污管网为主要治污措施的治理方案都不会成功。

　　在不达标的河长考核断面治理中，精准去除各种超标污染物才是根本。既然有污水流入河道是长期存在的客观事实。那么如何处理入河污水就是首要问题了。从水污染的现状来分析，污水是从陆上产生，就近流入小水沟，再流向支涌，干流等有规律传输。从广东省很多河长考核断面水质不达标的情况来分析，主要存在问题是流域主要支涌“一河一策”整治工作没有实质性进展。这就引伸出一个结论，去除流域主要污染支涌的水污染物，是不达标河长考核断面的主攻方向。人们可以在支涌下游的某处兴建水质净化设施（就是以小流域为治污控制单元），按干流河长考核断面的水质达标要求来处理支流的污染水体。这样就可以精准去除各个不达标河长考核断面所有超标污染物。从而完成河长考核断面水质达标的任务。

　　在完成河长考核断面水质达标这个任务后。若流域内还有些支涌存在黑臭水体，就要从该支涌下游兴建的水质净化设施出水中，反向引水到该支涌的上游，对该支涌进行生态补水，必要时沿河涌进行局部截污，减少河涌中的污水量，相应减少补水规模。补水的水质最好是低氨氮，高溶解氧。这样有利于河涌消除黑臭和有鱼类在河涌中生活。